Jetzt hab ich es mit Hilfe dieses Beitrags hinbekommem
https://forum.iobroker.net/topic/33435/defekte-admin-0-instanzen-lässt-sich-nicht-löschen
iobroker object get system.adapter.modbus.0 common.host
Gab den Hostname des verschrotteten iobroker Slaves aus, deswegen konnte ich mit dem Master die Instanz nicht löschen.
Mit
iobroker object set system.adapter.modbus.0 common.host=iobroker
habe ich die den aktuellen Hostname gesetzt und dann konnte ich auch die modbus.0 Instanz löschen.