Ich hab es gerettet bekommen. Also an alle die, nur noch die Dateien haben: Es steht eigentlich alles in den Dateien drin.
Jetzt mal zu dem, was ich raus gefunden habe und wie ich es wieder hin bekommen habe.
Neues, sauberes ioBroker installiert, in neuem Pfad.
Iobroker stoppen
In dem Ordner iobroker-data/files sind quasi die Setups aller eurer Adapter. Die sind aber soweit clean. Adaptereinstellungen oder gar Skripte sind da nicht gespeichert. Dort kann man erstmal alles aus dem alten iobroker Verzeichnis rein kopieren. Vorhandene sollten nicht ersetzt werden.
Alles was ihr an Skripten und Einstellungen gemacht habt, ist in der Datei iobroker-data/objects.json. Diese Datei war bei mir zerschossen und nur noch 5kb groß. Da ist mir der Arsch auf Grundeis gegangen, weil ich dachte nun ist alles weg. Aber es gibt den Ordner backup-objects. Da sind tatsächlich regelmäßige Backups sind. Die Dateiendung .gz kann man mit 7-zip entpacken. Das habe ich mit der states.json auch gemacht. Diese beiden Dateien habe ich dann im neuen iobroker an die entsprechende Stelle kopiert und die vorhandenen ersetzt.
Nun habe ich iobroker wieder gestartet und es war schon mal das Meiste wieder da.
PS. FHEM und Node-Red sind extra "Programme". Die sind nach einer Neuinstallation von iobroker nicht weg oder zurück gesetzt und die Einstellungen dort werden mit einem iobroker Backup auch nicht gesichert.